2013年末，永嘉县共有各类卫生机构513家，其中，医院10家、卫生院（社区卫生服务中心）37家、个体诊所68家、门诊部34家、医务室10家、社区卫生服务站57家、卫生室296家。卫生机构实有床位1465张，执业医师和执业助理医师有1609人,每万人拥有医生数为17人，注册护士1033人。2013年基础免疫接种率分别为:乙肝疫苗99.9%，卡介苗99.9%，糖丸99.8%，百白破99.7%，麻疹99.7%。